报告中显示，造成我 国食品污染的直接原因系源头污染，据对农村生产者的调查，绝大部分农民不知国家明令禁止使用的农药和售药目录；近50%的农民在使用农药和售药时没有农业技术人员指导，只是凭感觉，一药多用现象特别普遍；一些农民受利益驱动，打过农药的蔬菜未过休药期即采摘上市销售；68.9%的蔬菜上市前没有经过产地检验；10%以上的种植地和养殖地周边环境存在污染源。

此外，由于对食品安全事件处罚过轻，以罚代刑，导致部分批发商和农贸市场不愿意在食品卫生管理方面加大投入，即使建立了市场准入制度，也只是流于形式，并未付诸行动。

报告中还说，部分连锁超市在食品安全控制方面也存在一些薄弱环节，在采购、运输、销售方面都存在危害食品安全、损害消费者利益的问题。其中主要问题集中在标签不符、添加剂超标等，其中50%的标签缺斤少两。问题最多的是鲜肉及肉制品，占24%，休闲食品和乳品类，分别占15%和11%。